Kobe es un importante nudo ferroviario en la región japonesa de Kansai, situado entre Osaka, Himeji y el corredor occidental de Honshu. La ciudad cuenta con varias estaciones de pasajeros importantes, encabezadas por Shin-Kobe para los servicios de Shinkansen y Sannomiya para las rutas regionales centrales y de ferrocarril privado. JR West, JR Central, Hankyu Railway, Hanshin Electric Railway y Kobe New Transit prestan servicio en partes clave de la red ferroviaria de Kobe.
Los trenes de alta velocidad desde Kobe utilizan la estación de Shin-Kobe en el Sanyo Shinkansen, con servicios directos en el corredor del Tokaido Shinkansen. Los trenes regionales de JR West usan Sannomiya, Kobe y otras estaciones de la ciudad en la línea JR Kobe, mientras que Hankyu y Hanshin operan servicios de ferrocarril privado que conectan Kobe con el área de Osaka. Kobe New Transit opera el Port Liner entre Sannomiya y el aeropuerto de Kobe.
Las rutas ferroviarias desde Kobe van hacia el este a Osaka, Kioto, Nagoya y Tokio; hacia el oeste a Himeji, Okayama, Hiroshima y Fukuoka; y hacia el sur al aeropuerto de Kobe mediante el Port Liner. Los billetes de tren para Kobe pueden requerir Shin-Kobe para el tren de alta velocidad o Sannomiya para los servicios regionales. Reserva trenes desde y hacia Kobe en línea en Rail Monsters.