Saitama es uno de los centros ferroviarios más importantes del área metropolitana de Tokio, situado inmediatamente al norte de Tokio en los principales corredores de JR East hacia el norte y el centro de Japón. La ciudad cuenta con varias estaciones de pasajeros, y la estación Omiya actúa como principal estación de trenes de larga distancia y como uno de los puntos de transbordo más concurridos de la red de JR East.
Los trenes desde Saitama incluyen servicios Shinkansen en los corredores Tohoku, Joetsu, Hokuriku, Yamagata y Akita, además de trenes locales y rápidos de JR East que conectan la ciudad con Tokio, Ueno, Shinjuku y las prefecturas cercanas. Omiya también conecta con servicios de Tobu Railway en la línea Tobu Urban Park, mientras que algunos servicios Narita Express ofrecen una conexión ferroviaria con el aeropuerto hacia el aeropuerto de Narita.
Las rutas ferroviarias desde Saitama se dirigen al sur hacia el centro de Tokio y Yokohama, al norte hacia Utsunomiya, Sendai y Morioka, al noroeste hacia Takasaki y Niigata, y al oeste hacia Nagano, Toyama y Kanazawa. Reserva trenes desde y hacia Saitama en línea en Rail Monsters.