Yatsushiro es un nudo ferroviario en el sur de la prefectura de Kumamoto, situado entre el corredor del Kyushu Shinkansen y las líneas regionales a lo largo del mar de Yatsushiro. La ciudad cuenta con dos principales estaciones de tren de pasajeros: Shin-Yatsushiro para los servicios de tren bala y Yatsushiro Station para el tren regional. JR Kyushu y Hisatsu Orange Railway son los principales operadores que prestan servicio en la ciudad.
Los trenes desde Yatsushiro incluyen servicios de Kyushu Shinkansen en Shin-Yatsushiro, servicios locales y regionales de JR Kyushu en Yatsushiro Station, y trenes de Hisatsu Orange Railway que circulan hacia el sur沿沿 la costa. Shin-Yatsushiro es la principal estación de tren para billetes de tren de larga distancia, mientras que Yatsushiro Station gestiona las conexiones ferroviarias locales y los transbordos hacia la ruta de Orange Railway.
Las rutas ferroviarias desde Yatsushiro parten hacia el norte en dirección a Kumamoto, Kurume y Fukuoka, hacia el sur a Sendai y Kagoshima-Chuo, y hacia el suroeste a lo largo del corredor costero hasta Minamata e Izumi. Los trenes a Yatsushiro usan Shin-Yatsushiro para el Shinkansen y Yatsushiro Station para las llegadas regionales. Reserva trenes desde y hacia Yatsushiro online en Rail Monsters.