Maibara è un importante nodo ferroviario nella parte orientale della prefettura di Shiga, situato tra i corridoi ferroviari del Kansai, del Chubu e dell'Hokuriku. La città ruota attorno alla stazione di Maibara, dove i servizi Shinkansen di JR Central incontrano le linee ferroviarie convenzionali di JR West e la linea principale della Ohmi Railway. Questo rende Maibara un importante punto di interscambio più che una grande città capolinea.
I servizi ferroviari da Maibara includono i treni Tokaido Shinkansen sul corridoio Tokyo - Nagoya - Kyoto - Osaka, i treni regionali JR West sulla Biwako Line e sulla Hokuriku Main Line, e i servizi limited express che utilizzano la rete convenzionale verso il nord della prefettura di Shiga e la prefettura di Fukui. La stazione di Maibara è anche il punto di accesso ferroviario locale per i treni della Ohmi Railway che servono le comunità a est del lago Biwa.
I treni da Maibara viaggiano verso ovest in direzione di Kyoto, Osaka e Kobe, verso est in direzione di Nagoya e Tokyo, verso nord in direzione di Nagahama, Tsuruga e della regione di Hokuriku, e verso sud attraverso la rete della Ohmi Railway in direzione di Hikone e delle cittadine della Shiga. I viaggiatori che acquistano biglietti del treno per Maibara dovrebbero controllare attentamente la stazione perché qui i trasferimenti tra Shinkansen e servizi regionali sono comuni. Prenota online i treni da e per Maibara su Rail Monsters.