Nagoya è uno dei principali nodi ferroviari del Giappone, situato tra Tokyo e la regione del Kansai sulla Tokaido Shinkansen. La città dispone di diverse grandi stazioni passeggeri nell'area centrale, con JR Central, Meitetsu, Kintetsu e la linea Aonami che servono diverse parti della rete. Nagoya Station è la principale stazione ferroviaria per lo shinkansen e i servizi JR regionali.
I treni da Nagoya includono servizi Tokaido Shinkansen, treni JR Central limited express e locali, servizi aeroportuali e regionali Meitetsu e treni intercity Kintetsu verso l'Aichi occidentale e la prefettura di Mie. Meitetsu Nagoya Station e Kintetsu Nagoya Station si trovano accanto al complesso della stazione JR, mentre Kanayama funge da importante punto di interscambio per i servizi JR Central e Meitetsu.
Le linee ferroviarie da Nagoya si dirigono a est verso Tokyo e Yokohama, a ovest verso Kyoto, Osaka e Kobe, a nord verso Takayama e Gifu, a sud verso il Chubu Centrair International Airport e a sud-ovest verso Ise, Tsu e Matsusaka. Prenota online i treni da e per Nagoya su Rail Monsters.