Faro è una meta ferroviaria importante in Portogallo, che offre collegamenti con diverse grandi città. La tratta da Faro a Lisbona è di circa 278 chilometri, con treni che impiegano circa 2,5 - 3 ore. Un altro percorso significativo è Faro-Porto, che copre circa 593 chilometri, il quale richiede normalmente un trasferimento e impiega circa 6-7 ore. Inoltre, il percorso da Faro ad Albufeira si estende per circa 40 chilometri, con treni diretti disponibili che impiegano circa 50 minuti. Il servizio ferroviario collega anche Faro con le città minori della regione dell'Algarve, come Lagos e Tavira, facilitando i viaggi regionali.