Shenzhen jest jednym z najbardziej ruchliwych węzłów kolejowych południowych Chin, położonym w sieci kolejowej delty Rzeki Perłowej, między Guangzhou, Hongkongiem a trasami wzdłuż wybrzeża do Fujian. Miasto ma kilka głównych stacji pasażerskich, a Shenzhen North i Futian obsługują większość pociągów dużych prędkości. China Railway obsługuje główne połączenia międzymiastowe, dużych prędkości i konwencjonalne, które służą Shenzhen.
Pociągi z Shenzhen obejmują składy dużych prędkości serii G, usługi CRH serii D, pociągi międzymiastowe serii C oraz niektóre konwencjonalne pociągi dalekobieżne. Shenzhen North to główna stacja kolejowa dla krajowych tras dużych prędkości, natomiast Futian leży bliżej centralnej dzielnicy biznesowej i obsługuje połączenia dużych prędkości do Guangzhou i Hong Kong West Kowloon. Shenzhen Railway Station w pobliżu Luohu pozostaje ważna dla ruchu konwencjonalnego i międzymiastowego.
Trasy kolejowe z Shenzhen biegną na północny zachód do Guangzhou i Wuhan, na północ do Changsha i Pekinu, na wschód wzdłuż wybrzeża do Xiamen i Fuzhou oraz na południe przez granicę do Hong Kong West Kowloon. Połączenia regionalne łączą też Shenzhen z Dongguan, Huizhou i innymi miastami delty Rzeki Perłowej. Zarezerwuj pociągi z i do Shenzhen online w Rail Monsters.