Ateny są głównym pasażerskim węzłem kolejowym w Grecji i południowym filarem krajowej sieci kolejowej. Miasto obsługuje Hellenic Train, a stacja Athens Larissa Station pełni funkcję głównego dworca dla połączeń dalekobieżnych i regionalnych. Szerszy obszar kolejowy Aten obejmuje także stację Athens Airport oraz podmiejskie przystanki kolejowe wykorzystywane przez pociągi Proastiakos.
Pociągi z Aten obejmują połączenia InterCity na głównej linii północ–południe w kierunku środkowej i północnej Grecji, pociągi regionalne do pobliskich miejscowości oraz podmiejską kolej Proastiakos łączącą stolicę z lotniskiem, Pireusem, Kiato i Chalkidą. Stacja Athens Larissa Station obsługuje większość biletów na pociągi między miastami, natomiast stacja Athens Airport służy pasażerom kolei przyjeżdżającym na lotnisko Eleftherios Venizelos lub z niego odjeżdżającym.
Trasy kolejowe z Aten biegną na północ do Salonik, Larisy i Kalambaki przez środkową Grecję, na zachód do Kiato na korytarzu Peloponezu, na wschód do Chalkidy oraz na południowy wschód do lotniska w Atenach. Niektóre podróże wymagają przesiadki na stacjach pośrednich, takich jak Paleofarsalos lub Kiato. Rezerwuj pociągi z Aten i do Aten online w Rail Monsters.