Kagoshima posiada kluczowe stacje kolejowe, które wspierają zarówno lokalne, jak i regionalne potrzeby transportowe. Stacja Kagoshima-Chuo pełni funkcję głównego węzła, zapewniając dostęp do linii Shinkansen w kierunku dużych miast, takich jak Fukuoka i Osaka. Ta stacja łączy się z lokalnymi pociągami i autobusami, ułatwiając podróżowanie w obrębie prefektury. Stacja Kagoshima jest mniejsza i głównie obsługuje lokalne linie, łącząc podróżnych z pobliskimi miejscowościami, takimi jak Ibusuki i Satsumasendai. Stacja ta ma również dostęp do usług promowych dla osób podróżujących na Sakurajimę, ikoniczną wyspę wulkaniczną widoczną z miasta.