Aomori situa-se na extremidade norte da rede ferroviária de Honshu, no Japão, onde os serviços Shinkansen ligam o corredor de Tohoku a Hokkaido. A cidade tem duas principais estações de passageiros: Shin-Aomori para os comboios de alta velocidade e Aomori Station para os serviços regionais mais perto do centro da cidade. JR East, JR Hokkaido e a Aoimori Railway servem a área de Aomori.
Os comboios a partir de Aomori incluem serviços Hayabusa Shinkansen no Tohoku Shinkansen e no Hokkaido Shinkansen, comboios regionais JR East na Ou Main Line e na Tsugaru Line, e comboios da Aoimori Railway ao longo do antigo corredor da Tohoku Main Line. Shin-Aomori é a principal estação ferroviária para viagens em comboio-bala, enquanto Aomori Station trata de muitas partidas locais e regionais.
As rotas ferroviárias a partir de Aomori seguem para sul em direção a Hachinohe, Morioka, Sendai e Tóquio, para norte através do Túnel Seikan em direção a Shin-Hakodate-Hokuto, em Hokkaido, e para oeste em direção a Hirosaki nos serviços regionais da JR East. Reserve online comboios de e para Aomori na Rail Monsters.