Nagano possui serviços de comboio significativos que a ligam a várias regiões. A estação principal, Estação de Nagano, é uma paragem importante na linha Hokuriku Shinkansen, proporcionando acesso rápido a Tóquio, Kanazawa e Toyama. Além disso, linhas locais como a Ferroviária Elétrica de Nagano ligam-se aos destinos próximos de Yudanaka e Shibu na Linha Nagaden. A estação também acomodam serviços para as áreas montanhosas circundantes que atraem visitantes, especialmente durante a época de inverno para esquiar. No geral, as ligações ferroviárias garantem opções de viagem convenientes para e a partir de Nagano.