Iksan é um importante entroncamento ferroviário na província de Jeolla do Norte, onde se encontram a Linha Honam, a Linha Jeolla e a Linha Janghang. A cidade tem um principal centro ferroviário de passageiros, a Estação de Iksan, servida pela Korail e pela SR. Esta posição faz de Iksan um ponto de transbordo importante entre a área de Seul, o oeste da Coreia do Sul e a região de Jeolla.
Os serviços a partir de Iksan incluem comboios de alta velocidade KTX, comboios de alta velocidade SRT, comboios interurbanos ITX-Saemaeul e serviços regionais Mugunghwa. A Estação de Iksan é a principal estação ferroviária para viagens de longa distância e regionais, com o KTX e o SRT a utilizarem a rede de alta velocidade e os comboios convencionais a usarem os antigos corredores regionais.
As rotas ferroviárias a partir de Iksan seguem para norte em direção a Seul, Yongsan, Suseo, Cheonan-Asan e Daejeon, para sul em direção a Gwangju-Songjeong, Mokpo, Jeonju, Suncheon e Yeosu-Expo, e para oeste em direção a Gunsan, no corredor da Linha Janghang. Reserve online comboios de e para Iksan na Rail Monsters.