Aveiro situa-se na Linha do Norte, o principal eixo ferroviário de Portugal entre Lisboa e Porto. A cidade tem uma principal estação de passageiros, Aveiro, com a CP - Comboios de Portugal a operar serviços de longo curso, regionais e urbanos através da estação. A sua localização torna Aveiro uma paragem ferroviária prática entre as partes norte e central de Portugal.
Os comboios de Aveiro incluem serviços de alta velocidade Alfa Pendular, comboios interurbanos Intercidades, serviços CP Regional e comboios urbanos do Porto na linha de Aveiro. A estação de Aveiro trata do principal tráfego ferroviário nacional, enquanto as paragens locais à volta do município servem movimentos regionais mais curtos em serviços selecionados.
As ligações ferroviárias a partir de Aveiro seguem para norte em direção ao Porto, Braga e ligações a Guimarães, para sul em direção a Coimbra, Lisboa e o Algarve, e ao longo de corredores regionais que servem localidades no Baixo Vouga e no centro de Portugal. Destinos ferroviários comuns incluem Porto Campanhã, Coimbra-B, Lisboa Oriente, Lisboa Santa Apolónia, Braga e Faro. Reserve comboios de e para Aveiro online na Rail Monsters.