A rota de Fernando Po para Pegoes é servida principalmente pelo comboio Alfa Pendular, que é o serviço de comboio mais rápido em Portugal. Ele opera a velocidades que atingem até 220 km/h (137 mph), tornando a viagem entre esses dois locais relativamente rápida, levando cerca de 2 horas e 30 minutos. Este comboio de alta velocidade conecta grandes cidades e oferece recursos como assentos confortáveis, um vagão-restaurante e acesso Wi-Fi.
Além disso, o comboio Intercidades também serve esta rota, oferecendo velocidades ligeiramente mais baixas de cerca de 160 km/h (99 mph) e tendo mais paradas ao longo do caminho, potencialmente estendendo o tempo de viagem para cerca de 3 horas. Embora o Alfa Pendular seja a escolha recomendada para aqueles que priorizam a velocidade, o Intercidades pode ser adequado para viajantes que procuram uma opção mais acessível com a chance de explorar paradas adicionais.