Málaga é o principal nó ferroviário da Costa del Sol e a extremidade sul de um importante corredor de alta velocidade a partir de Madrid, passando por Córdoba e Antequera. A cidade tem duas estações centrais de passageiros, além da paragem ferroviária do aeroporto, com Málaga María Zambrano a funcionar como a principal estação para serviços de longa distância. Renfe, Iryo, Ouigo España e os serviços locais de Cercanías operam todos na área ferroviária de Málaga.
Os bilhetes de comboio de Málaga abrangem várias categorias de serviço. Os comboios de alta velocidade AVE, Avlo, Iryo e Ouigo España utilizam Málaga María Zambrano para viagens de longa distância por Espanha. Os serviços Media Distancia e Avant apoiam ligações regionais dentro da Andaluzia, enquanto os comboios Cercanías Málaga ligam o centro da cidade ao Aeroporto de Málaga-Costa del Sol e a localidades costeiras na linha C-1.
As rotas ferroviárias a partir de Málaga seguem para norte, rumo a Córdoba, Madrid, Saragoça e Barcelona, para oeste através da Andaluzia em direção a Sevilha, e para leste ou para o interior através de ligações regionais rumo a Granada e Antequera. Os serviços ferroviários costeiros ligam Málaga a Torremolinos, Benalmádena e Fuengirola. Reserve online comboios de e para Málaga na Rail Monsters.