Zhubei é a principal cidade ferroviária do condado de Hsinchu e ocupa uma posição invulgar na rede de Taiwan: a cidade tem tanto uma estação da Taiwan Railways na Western Trunk Line como a estação Hsinchu High Speed Rail dentro dos seus limites. A Taiwan Railways serve o centro de Zhubei, enquanto a Taiwan High Speed Rail utiliza a Hsinchu Station, no leste de Zhubei, para comboios interurbanos de alta velocidade.
Os comboios de Zhubei abrangem dois padrões de serviço diferentes. Os comboios locais e regionais da Taiwan Railways param na Zhubei Station para viagens ao longo do corredor convencional da costa oeste. Os comboios de alta velocidade da THSR param na Hsinchu HSR Station para viagens norte-sul através do oeste de Taiwan. A Liujia Station, na Liujia Line da Taiwan Railways, liga a área da HSR à cidade de Hsinchu por comboio.
As rotas ferroviárias a partir de Zhubei seguem para norte em direção a Taoyuan, Banqiao, Taipei e Nangang, para sul em direção a Miaoli, Taichung, Chiayi, Tainan e Zuoying, e para oeste em direção à cidade de Hsinchu nos serviços da Taiwan Railways. Não existe uma estação ferroviária direta para o aeroporto em Zhubei, mas as ligações ferroviárias para Taoyuan conectam com o transporte aeroportuário. Reserve online comboios de e para Zhubei em Rail Monsters.