Istambul tem uma rede de estações de comboios importantes que ligam a cidade a vários destinos em todo o Turquemen. O principal ponto de hub é a Estação de Comboios de Haydarpaşa, localizada em Kadıköy, que serve principalmente comboios intermunicipais e oferece acesso a destinos como Ancara e Adana. A estação apresenta uma arquitetura histórica e é um ponto de transporte importante no lado asiático de Istambul. Outra estação principal é a Estação de Comboios de Sirkeci, no distrito de Eminönü, que serve principalmente comboios com destino à Europa Oriental e destinos locais. Esta estação também é conhecida pelo seu design impressionante e importância histórica. A estação principal da TCDD em Istambul é a estação de Halkalı, localizada no lado europeu, que opera comboios de alta velocidade para cidades como Edirne e outras regiões. Além disso, a Estação de Comboios de Pendik suporta uma variedade de serviços locais e intermunicipais, melhorando a conectividade no lado asiático. Estações menores, como Çerkezköy e a Estação do Aeroporto de Istambul Atatürk, são utilizadas principalmente para comboios locais e serviços regionais, facilitando o transporte em áreas próximas. A distância entre as estações principais varia, geralmente variando entre 10 a 30 quilómetros, dependendo do distrito e da linha ferroviária.