Наньнін — головний залізничний вузол Гуансі-Чжуанського автономного району та важливий пересадковий пункт у пасажирській мережі південного Китаю. У місті є дві основні пасажирські залізничні станції: залізнична станція Наньнін поблизу центральної частини міста та залізнична станція Наньнін-Захід на високошвидкісній мережі. China Railway обслуговує міжміські, високошвидкісні та регіональні перевезення, що робить Наньнін важливим пунктом пересадки між Гуансі, Гуандуном, Юньнанем, Гуйчжоу та Сичуанем.
Високошвидкісні поїзди з Наньніна переважно вирушають із Наньнін-Захід для більшості далеких рейсів, включно з поїздами категорій G і D на коридорах у напрямку Гуандуна, Юньнаня та Гуйчжоу. Залізнична станція Наньнін також обслуговує міжміські та звичайні рейси, зокрема регіональні поїзди по всьому Гуансі. Деякі рейси зупиняються і в Наньніні, і в Наньнін-Захід, тому пасажирам слід перевіряти назву станції, вказану на кожному квитку, перед бронюванням.
Залізничні маршрути з Наньніна прямують на схід до Гуанчжоу та Шеньчженя, на північ до Лючжоу, Гуйліня та Гуйяна, на захід до Байсе та Куньміна, і на південь до Ціньчжоу, Бейхаю та Фанченгана на узбережжі Гуансі. Бронюйте поїзди з Наньніна та до Наньніна онлайн на Rail Monsters.