Шеньчжень — один із найзавантаженіших залізничних вузлів Південного Китаю, розташований у залізничній мережі дельти Перлинної річки між Гуанчжоу, Гонконгом і прибережними маршрутами до Фуцзяні. У місті є кілька великих пасажирських станцій, причому Шеньчжень Північний і Футянь обслуговують більшість високошвидкісних потягів. China Railway здійснює основні міжміські, високошвидкісні та звичайні перевезення, що обслуговують Шеньчжень.
Потяги зі Шеньчженя включають високошвидкісні потяги серії G, послуги CRH серії D, міжміські потяги серії C та деякі звичайні далекі потяги. Шеньчжень Північний — головна залізнична станція для національних високошвидкісних маршрутів, тоді як Футянь розташований ближче до центрального ділового району та обслуговує високошвидкісні маршрути до Гуанчжоу й Гонконгського Західного Коулуна. Залізнична станція Шеньчженя поблизу Лоху залишається важливою для звичайних і міжміських перевезень.
Залізничні маршрути зі Шеньчженя прямують на північний захід до Гуанчжоу та Уханя, на північ до Чанші та Пекіна, на схід уздовж узбережжя до Сяменя та Фучжоу, а на південь через кордон до Гонконгського Західного Коулуна. Регіональні сполучення також з'єднують Шеньчжень із Дунгуанем, Хуейчжоу та іншими містами дельти Перлинної річки. Бронюйте потяги зі Шеньчженя та до Шеньчженя онлайн на Rail Monsters.