Ліон — один із головних залізничних вузлів Франції, розташований там, де північ–південна швидкісна вісь перетинається з регіональними маршрутами до Альп, Бургундії та долини Рони. У місті є кілька пасажирських станцій, причому Lyon Part-Dieu є основною станцією далекого сполучення, а Lyon Perrache обслуговує багато регіональних та міжміських рейсів. SNCF Voyageurs здійснює основне залізничне обслуговування в Ліоні через TGV INOUI, OUIGO та TER Auvergne-Rhone-Alpes.
Потяги з Ліона включають швидкісні рейси на національних коридорах, регіональні поїзди TER по всій східній Франції та вибрані транскордонні регіональні сполучення до Швейцарії. Lyon Saint-Exupery TGV обслуговує район аеропорту на швидкісній лінії на схід від міста, тоді як Lyon Jean Mace та інші міські зупинки підтримують регіональні залізничні перевезення в межах агломерації.
Залізничні маршрути з Ліона прямують на північ до Парижа та Діжона, на південь до Авіньйона та Марселя, на схід до Гренобля, Ансі, Шамбері та Женеви, а на захід до Сент-Етьєна та центральної Франції. Мандрівникам, які бронюють залізничні квитки до Ліона, слід уважно перевіряти станцію відправлення, оскільки далекі та регіональні поїзди можуть використовувати різні станції Ліона. Бронюйте потяги з Ліона та до Ліона онлайн на Rail Monsters.