Залізнична станція Джоетсу-Мйоко має 2 платформи, що обслуговують лінію Хокуріку Сінкансен. Платформа 1 обслуговує потяги, що прямують до Нагано, тоді як Платформа 2 призначена для потягів, які їдуть до Каназави. Станція обладнана автоматами для продажу квитків та касами, розташованими на першому поверсі, які надають послуги японською та англійською мовами. Є чітка інформаційна вивіска, щоб допомогти мандрівникам дістатися до платформ, з ескалаторами та ліфтами для тих, хто має тяжкий багаж або проблеми з мобільністю. Компоновка станції робить її простий для навігації, платформи безпосередньо доступні з основної каси, що забезпечує швидкий перехід між потягами.