Ноборібецу розташований на лінії JR Hokkaido Muroran Main Line у південному Хоккайдо, між Томакомаї та Хігасі-Мурораном. У місті є одна головна міжміська залізнична станція — Noboribetsu Station, яка функціонує як зупинка для поїздів limited express і місцевих поїздів, а не як кінцева станція. Її залізнична роль пов’язана з коридором Саппоро - Хакодате, одним із найважливіших звичайних залізничних маршрутів Хоккайдо.
Поїзди з Ноборібецу включають експрес-рейси JR Hokkaido, такі як Hokuto на осі Саппоро - Хакодате, рейси Suzuran у напрямку Саппоро та Мурорана, а також місцеві поїзди вздовж Muroran Main Line. Мережа Shinkansen Японії не доходить до Ноборібецу; доступ до швидкісної залізниці потребує поїздки через Shin-Hakodate-Hokuto в південному Хоккайдо.
Залізничні маршрути з Ноборібецу прямують на північний схід до Томакомаї, Minami-Chitose, сполучень до New Chitose Airport і Саппоро, а також на південний захід до Хігасі-Мурорана, Тоя, Осаммбє, Shin-Hakodate-Hokuto та Хакодате. Для регіональних подорожей місцеві поїзди JR Hokkaido з’єднують Ноборібецу з найближчими станціями району Мурорана. Бронюйте поїзди з Ноборібецу та до Ноборібецу онлайн на Rail Monsters.