Саппоро є головним залізничним вузлом Хоккайдо, розташованим у центрі міжміської мережі JR Hokkaido. Місто обслуговується станцією Sapporo Station як головним вокзалом, а Shin-Sapporo та кілька приміських станцій підтримують регіональні й місцеві подорожі. На відміну від міст у нинішній мережі Shinkansen Японії, Саппоро поки що не обслуговується швидкісними поїздами.
Поїзди із Саппоро включають обмежено-експресні рейси JR Hokkaido по всьому острову, поїзди Rapid Airport до аеропорту New Chitose та місцеві поїзди на лініях Hakodate Main Line, Chitose Line і Sassho Line. Sapporo Station обслуговує майже всі далекі відправлення, тоді як Shin-Sapporo корисна для рейсів Chitose Line і пересадок у східній частині міста.
Залізничні маршрути із Саппоро прямують на південь до Hakodate і Tomakomai, на північ до Asahikawa і Wakkanai, на схід до Obihiro, Kushiro і Abashiri, а на південний схід до New Chitose Airport. Квитки на потяг можна забронювати на обмежено-експресні, аеропортові та регіональні рейси. Бронюйте поїзди з Саппоро та до Саппоро онлайн на Rail Monsters.