Якумо розташоване на лінії Хакодате Мейн у південному Хоккайдо, між районом Саппоро та залізничним коридором Хакодате. У місті є одна головна пасажирська залізнична станція — станція Якумо, яку обслуговує JR Hokkaido. Її залізнична роль є регіональною, але важливою для мандрівників, які пересуваються між південним узбережжям Хоккайдо та центральною залізничною віссю острова.
Серед сполучень із Якумо — поїзди JR Hokkaido Limited Express Hokuto та місцеві рейси лінії Хакодате Мейн. Станція Якумо є головною залізничною станцією для поїздів із Якумо, а експреси з місцями за резервуванням з’єднують місто з основними міжміськими станціями Хоккайдо, тоді як місцеві поїзди обслуговують сусідні громади на тій самій лінії. Швидкісні поїзди Shinkansen не обслуговують Якумо безпосередньо; пасажири користуються станцією Шін-Хакодате-Хокуто для пересадки на Shinkansen.
Залізничні маршрути з Якумо прямують на північ до Ошаманбе, Тоя, Ноборібецу та Саппоро, а на південь — до Морі, Шін-Хакодате-Хокуто, Горіокаку та Хакодате. Квитки на потяги для Якумо найактуальніші для міжміських поїздок Хоккайдо та для пересадок на Hokkaido Shinkansen у Шін-Хакодате-Хокуто. Забронюйте поїзди з Якумо та до Якумо онлайн на Rail Monsters.