Гонджу — менша, але важлива зупинка в мережі швидкісних залізниць Південної Кореї, розташована на лінії високошвидкісної залізниці Хонам між районом Сеула та південним заходом. Місто обслуговує одна основна пасажирська залізнична станція, Gongju Station, а рейси KTX виконуються Korail, тоді як рейси SRT — SR.
Потяги з Гонджу включають швидкісні рейси KTX і SRT, а не великий вибір звичайних міжміських поїздів. Gongju Station обслуговує міжміські потяги з резервованими місцями на коридорі Хонам, з’єднуючи місто з основними пересадковими вузлами в районі Сеула, Північного Чхунчхону, Північної Чолли та Південної Чолли. У Гонджу немає прямої залізничної станції до аеропорту, тому пасажири, які прямують до аеропорту, зазвичай роблять пересадку через більші залізничні вузли.
Залізничні маршрути з Гонджу йдуть на північ до Осонга, Чхонан-Асама, Сеула, Йонсану та Сусео, а на південь — до Іксана, Чонґубу, Ґванджу-Сонджона, Наджу та Мокпо. Для квитків на потяг перевіряйте, чи ваш відправний рейс виконує Korail KTX або SR SRT, оскільки станції району Сеула відрізняються залежно від перевізника. Бронюйте потяги до та з Гонджу онлайн на Rail Monsters.