Малага є головним залізничним вузлом Коста-дель-Соль і південним кінцем великого високошвидкісного коридору з Мадрида через Кордову та Антекеру. У місті є дві центральні пасажирські станції, а також зупинка залізниці в аеропорту, причому Málaga María Zambrano є головною станцією для далеких поїздів. Renfe, Iryo, Ouigo España та місцеві сервіси Cercanías усі працюють у залізничній зоні Малаги.
Квитки на поїзд із Малаги охоплюють кілька категорій перевезень. Високошвидкісні поїзди AVE, Avlo, Iryo та Ouigo España використовують Málaga María Zambrano для далеких подорожей Іспанією. Сервіси Media Distancia та Avant забезпечують регіональні сполучення в межах Андалусії, а поїзди Cercanías Málaga з'єднують центр міста з аеропортом Málaga-Costa del Sol і прибережними містами на лінії C-1.
Залізничні маршрути з Малаги прямують на північ до Кордови, Мадрида, Сарагоси та Барселони, на захід через Андалусію до Севільї, а також на схід або вглиб країни через регіональні сполучення до Гранади та Антекери. Прибережні залізничні сервіси з'єднують Малагу з Торремоліносом, Бенальмаденою та Фуенхіролою. Бронюйте поїзди з Малаги та до Малаги онлайн на Rail Monsters.