糸鱼川是新潟县日本海一侧的区域铁路枢纽,位于北陆新干线上的上越妙高与富山之间。这座城市只有一个主要的客运铁路综合体——糸鱼川站,那里汇集了新干线、区域和本地列车服务。JR西日本、JR东日本经由新干线直通运行,以及越后心动铁道,是购买糸鱼川火车票时的主要运营方。
从糸鱼川出发,可搭乘北陆新干线长途列车、越后心动铁道日本海翡翠线列车,以及JR西日本大糸线本地列车。糸鱼川站是往返糸鱼川列车的主要火车站,在同一站名下,高速与本地铁路服务各自承担不同功能。
从糸鱼川出发的铁路线路向东通往上越妙高和长野,继续向南和向东通往东京走廊,向西通往富山、金泽和福井,并沿海岸通往直江津和泊。当地山线服务也开往南小谷。可在 Rail Monsters 在线预订往返糸鱼川的列车。