Santarem liegt an Portugals Linha do Norte, dem wichtigsten Bahnverkehrskorridor zwischen Lissabon, Coimbra und Porto. Die Stadt hat einen wichtigsten Personenbahnhof, Santarem, der von Comboios de Portugal, allgemein als CP bekannt, bedient wird. Seine Rolle ist eher regional und intercity als hochgeschwindig, wodurch Reisende Zugang zu Fernzügen und kürzeren Ribatejo-Verbindungen haben.
Zu den Zügen ab Santarem gehören CP Intercidades auf der Achse Lissabon - Porto, InterRegional-Züge, die mittelgroße Orte entlang des zentralen Korridors verbinden, sowie Regionalzüge für lokale Fahrten durch das Ribatejo und das Tejo-Tal. Der Bahnhof Santarem ist für die meisten Bahnreisen in der Stadt der Buchungspunkt, wobei die Verbindungen das nationale Breitspurnetz nutzen.
Bahnstrecken ab Santarem führen nach Süden in Richtung Lisboa Oriente und Lisboa Santa Apolonia, nach Norden in Richtung Entroncamento, Coimbra, Aveiro und Porto sowie nach Osten über Umstiege in Richtung Tomar oder den Beira-Baixa-Korridor. Santarem hat keinen eigenen Flughafenbahnhof, daher erfolgen Flughafenfahrten normalerweise über Lisboa Oriente und den anschließenden lokalen Verkehr. Buchen Sie Züge von und nach Santarem online bei Rail Monsters.