Auf der Strecke Funcheira nach Messines - Alte wird der Hauptzugdienst von den Regionalzügen betrieben, die von Comboios de Portugal gefahren werden. Diese Züge fahren normalerweise mit Geschwindigkeiten von 80 bis 150 km/h (50 bis 93 mph), abhängig von den Streckenabschnitten. Die Fahrt dauert ungefähr 30 Minuten, mit einigen Halten an kleineren Bahnhöfen entlang des Weges, was einen Blick auf die malerische Algarve-Region bietet. Die Zuggattung ist normalerweise ein Standard-Dieselzug, der gut für den Regionalverkehr ausgestattet ist und komfortable Sitze bietet, jedoch im Vergleich zu Hochgeschwindigkeitsoptionen begrenzte Annehmlichkeiten hat. Da es auf dieser Strecke keine Hochgeschwindigkeitszüge gibt, bleibt der Regionalzug die beste Option für Reisende, die effizient zwischen diesen Städten unterwegs sein möchten.