Der YunLin Bahnhof hat 4 Bahnsteige, die verschiedene Routen bedienen, darunter die Dienste der Taiwan Railways Administration (TRA), die in große Städte wie Taipeh und Kaohsiung fahren. Bahnsteig 1 ist für Expressdienste reserviert, während die Bahnsteige 2 und 3 lokale Züge bedienen. Bahnsteig 4 bietet Zugverbindungen nach Tainan. Die Fahrkartenschalter befinden sich im Hauptgebäude in der Nähe der Bahnsteige, was den Kauf von Fahrkarten vor der Abfahrt erleichtert. Orientierungsschilder sind im gesamten Bahnhof vorhanden, um den Passagieren zu helfen, Bahnsteige, Einrichtungen und Ausgänge zu finden. Die Toiletten befinden sich in der Nähe der Wartebereiche, und es gibt Einrichtungen, die für Passagiere mit eingeschränkter Mobilität konzipiert sind, darunter Rampen und barrierefreie Toiletten.