Huangshan es un importante nudo ferroviario en el sur de la provincia de Anhui, situado donde las líneas de alta velocidad conectan el delta del río Yangtsé con el interior de Anhui y Fujian. La ciudad cuenta con dos estaciones principales de pasajeros: Huangshan Norte para servicios de alta velocidad y la estación de Huangshan para trenes convencionales. China Railway opera los servicios de pasajeros que prestan servicio a Huangshan.
Los trenes de alta velocidad desde Huangshan Norte utilizan servicios de las series G y D en corredores hacia Hangzhou, Shanghái, Nankín, Hefei y Fuzhou. Los trenes convencionales utilizan la estación de Huangshan para servicios regionales y de larga distancia más lentos en la red antigua. El aeropuerto internacional Huangshan Tunxi no dispone de una estación ferroviaria directa, por lo que los viajeros en tren normalmente hacen transbordo a través de Huangshan Norte o la estación de Huangshan.
Las rutas ferroviarias desde Huangshan se dirigen al noreste hacia Hangzhou y Shanghái, al noroeste hacia Hefei y Nankín, al sur hacia Wuyishan y Fuzhou, y continúan por la red nacional de China Railway. Entre las principales ciudades de destino se incluyen Hangzhou, Shanghái, Nankín, Hefei, Fuzhou y Pekín. Reserve trenes desde y hacia Huangshan en línea en Rail Monsters.