Joetsu es un nudo ferroviario en el suroeste de la prefectura de Niigata, situado entre el corredor del Hokuriku Shinkansen y las líneas convencionales a lo largo de la costa del mar de Japón. La ciudad cuenta con dos estaciones principales para viajeros interurbanos: la estación de Joetsumyoko para servicios de tren bala y la estación de Naoetsu para trenes regionales y de expreso limitado. JR East, JR West, Echigo Tokimeki Railway y Hokuetsu Express prestan servicio en toda el área de Joetsu.
La estación de Joetsumyoko es la parada de tren bala de la ciudad, utilizada por los servicios del Hokuriku Shinkansen que circulan hacia el este en dirección a Nagano y Tokio y hacia el oeste hacia Toyama, Kanazawa y Tsuruga. La estación de Naoetsu gestiona rutas regionales en la red de Echigo Tokimeki Railway, servicios de expreso limitado de JR East hacia Niigata y trenes de Hokuetsu Express por el interior de Niigata.
Las rutas ferroviarias desde Joetsu salen hacia el sur y el este en dirección a Nagano, Takasaki, Omiya y Tokio, hacia el oeste por el corredor Hokuriku hacia Toyama y Kanazawa, hacia el norte en dirección a Kashiwazaki y Niigata, y por la línea costera hacia Itoigawa. Reserve trenes desde y hacia Joetsu en línea en Rail Monsters.