Sapporo es el principal nudo ferroviario de Hokkaido, situado en el centro de la red interurbana de JR Hokkaido. La ciudad cuenta con Sapporo Station como su estación principal, mientras que Shin-Sapporo y varias estaciones suburbanas dan soporte a los viajes regionales y locales. A diferencia de las ciudades de la actual red Shinkansen de Japón, Sapporo aún no cuenta con servicios de tren bala.
Los trenes desde Sapporo incluyen servicios JR Hokkaido Limited Express por toda la isla, trenes Rapid Airport hacia New Chitose Airport y trenes locales en la Hakodate Main Line, la Chitose Line y la Sassho Line. Sapporo Station gestiona casi todas las salidas de larga distancia, mientras que Shin-Sapporo resulta útil para los servicios de la Chitose Line y los transbordos en el lado este de la ciudad.
Las rutas ferroviarias desde Sapporo se dirigen al sur hacia Hakodate y Tomakomai, al norte hacia Asahikawa y Wakkanai, al este hacia Obihiro, Kushiro y Abashiri, y al sureste hacia New Chitose Airport. Los billetes de tren se pueden reservar para servicios Limited Express, aeroportuarios y regionales. Reserva trenes desde y hacia Sapporo online en Rail Monsters.