Shinagawa es uno de los principales nudos ferroviarios de Tokio, situado en la zona sur de la red ferroviaria central de la capital. La zona gira en torno a la estación de Shinagawa, una parada clave del Tokaido Shinkansen y un intercambiador de los servicios de JR East y Keikyu. Su papel ferroviario se define por el acceso de larga distancia hacia el oeste desde Tokio y por el acceso al aeropuerto hacia Haneda.
Los servicios desde Shinagawa incluyen servicios de tren bala de JR Central en el Tokaido Shinkansen, trenes urbanos y regionales de JR East en líneas como la línea Yamanote, la línea Keihin-Tohoku, la línea Tokaido, la línea Yokosuka, y trenes de Keikyu hacia el aeropuerto y la costa de Kanagawa. La estación de Shinagawa es la principal estación de tren para billetes de tren que implican viajes Shinkansen de larga distancia, mientras que la cercana Takanawa Gateway sirve servicios locales de JR East dentro de Tokio.
Las rutas ferroviarias desde Shinagawa van hacia el oeste a Nagoya, Kioto, Osaka e Hiroshima a través de los corredores Tokaido y Sanyo Shinkansen, hacia el sur a Yokohama y Kamakura en líneas de JR East, y hacia el sureste al aeropuerto de Haneda en Keikyu. Reserva trenes desde y hacia Shinagawa en línea en Rail Monsters.