Shinjo es un nudo ferroviario en el norte de la prefectura de Yamagata y el extremo norte del Yamagata Shinkansen. La ciudad cuenta con una estación principal de pasajeros, Shinjo Station, servida por JR East. Su función ferroviaria viene definida por el punto de encuentro de los servicios Tsubasa con estándar Shinkansen, la Ou Main Line y las líneas regionales por el Tohoku interior.
Los servicios de tren desde Shinjo incluyen trenes Tsubasa que circulan por el corredor del Yamagata Shinkansen, trenes regionales de la Ou Main Line hacia el sur por la prefectura de Yamagata y hacia el norte en dirección a la prefectura de Akita, y servicios locales en la Rikuu East Line. Shinjo Station gestiona tanto servicios de larga distancia con asiento reservado como trenes locales, lo que la convierte en la estación clave para billetes de tren en la zona de Mogami.
Las rutas ferroviarias desde Shinjo van al sur hacia Yamagata, Fukushima, Utsunomiya y Tokio, al norte hacia Yuzawa y Akita, y al este hacia Naruko-Onsen y Furukawa para conexiones en Tohoku. Los trenes hacia Shinjo también dan servicio a comunidades locales de todo el norte de Yamagata. Reserve trenes desde y hacia Shinjo online en Rail Monsters.