Fuji est une plaque tournante ferroviaire régionale dans l’est de la préfecture de Shizuoka, située sur le corridor du Tokaido entre Tokyo, Shizuoka, Nagoya et Osaka. La ville compte deux principales gares voyageurs pour les trajets interurbains : la gare de Shin-Fuji sur le Tokaido Shinkansen et la gare de Fuji sur les lignes JR Central conventionnelles. Shin-Fuji est l’une des rares gares Shinkansen du Japon qui ne soit pas directement reliée par rail à une gare JR conventionnelle, de sorte que les voyageurs doivent vérifier quelle gare de Fuji leur billet utilise.
JR Central exploite les principaux trains au départ de Fuji. Les services Kodama Shinkansen desservent Shin-Fuji pour les trajets à grande vitesse sur le Tokaido Shinkansen, tandis que la gare de Fuji gère les trains régionaux de la ligne principale Tokaido et la ligne Minobu vers le nord, à travers l’intérieur des terres de Shizuoka et la préfecture de Yamanashi. La correspondance entre Shin-Fuji et la gare de Fuji s’effectue en bus local, en taxi ou par transfert routier plutôt que par une liaison ferroviaire directe.
Les lignes ferroviaires au départ de Fuji partent vers l’est en direction de Mishima, Atami, Yokohama et Tokyo, vers l’ouest en direction de Shizuoka, Hamamatsu, Nagoya et Osaka, et vers le nord en direction de Fujinomiya, Minobu et Kofu sur la ligne Minobu. Réservez en ligne les trains au départ et à destination de Fuji sur Rail Monsters.