Kumamoto est un important pôle ferroviaire du centre de Kyushu, situé entre Fukuoka et Kagoshima sur le Kyushu Shinkansen. La ville compte une principale gare de trains longue distance, Kumamoto Station, ainsi que des arrêts régionaux comme Kami-Kumamoto et Shin-Suizenji. JR Kyushu est l’exploitant principal et assure des services Shinkansen, express limités et locaux à travers la ville.
Les trains au départ de Kumamoto incluent des services Kyushu Shinkansen sur le corridor à grande vitesse nord-sud, des services express limités JR Kyushu vers la région d’Aso, ainsi que des trains régionaux dans toute la préfecture de Kumamoto. Kumamoto Station est la principale gare pour les billets de train interurbains, tandis que Kami-Kumamoto et Shin-Suizenji assurent les trajets locaux et régionaux au sein du réseau ferroviaire urbain.
Les lignes ferroviaires au départ de Kumamoto partent vers le nord en direction de Hakata, Kurume et Shin-Tosu, vers le sud en direction de Kagoshima-Chuo, vers l’est en direction d’Aso et de la préfecture d’Oita, et au-delà vers Honshu grâce à des services Shinkansen directs ou avec correspondance vers Hiroshima et Shin-Osaka. Réservez en ligne des trains au départ et à destination de Kumamoto sur Rail Monsters.