Yakumo se situe sur la ligne principale Hakodate, dans le sud de Hokkaido, entre la région de Sapporo et le corridor ferroviaire de Hakodate. La ville dispose d’une seule grande gare voyageurs, la gare de Yakumo, desservie par JR Hokkaido. Son rôle ferroviaire est régional, mais important pour les voyageurs se déplaçant entre la côte sud de Hokkaido et l’axe ferroviaire central de l’île.
Les services au départ de Yakumo comprennent les trains JR Hokkaido Limited Express Hokuto et les services locaux de la ligne principale Hakodate. La gare de Yakumo est la principale gare pour les trains au départ de Yakumo, avec des services Limited Express à sièges réservés reliant la ville aux principales gares interurbaines de Hokkaido et des trains locaux desservant les communautés voisines sur la même ligne. Les trains Shinkansen à grande vitesse ne desservent pas directement Yakumo ; les passagers utilisent Shin-Hakodate-Hokuto pour les correspondances Shinkansen.
Les itinéraires ferroviaires depuis Yakumo partent vers le nord en direction d’Oshamambe, Toya, Noboribetsu et Sapporo, et vers le sud en direction de Mori, Shin-Hakodate-Hokuto, Goryokaku et Hakodate. Les billets de train pour Yakumo sont surtout pertinents pour les déplacements interurbains au sein de Hokkaido et pour les correspondances avec le Hokkaido Shinkansen à Shin-Hakodate-Hokuto. Réservez en ligne les trains au départ de Yakumo et à destination de Yakumo sur Rail Monsters.