Daisen è un nodo ferroviario nell'entroterra della prefettura di Akita, con la stazione di Omagari che funge da principale stazione ferroviaria e da interscambio della città. JR East serve la città con servizi Akita Shinkansen, treni regionali sulla linea principale Ou e servizi sulla linea Tazawako. Ciò rende Daisen un utile punto di collegamento tra Akita, il corridoio dello Tohoku Shinkansen e le comunità interne del sud di Akita.
I treni da Daisen includono i servizi Komachi sull'Akita Shinkansen, i treni regionali JR East a nord e a sud sulla linea principale Ou e i servizi locali sulla linea Tazawako. La stazione di Omagari è la principale per i biglietti ferroviari a lunga percorrenza, mentre altre fermate cittadine come Kariwano e Jinguji servono principalmente i viaggi regionali all'interno della prefettura di Akita.
Le linee ferroviarie da Daisen si dirigono a sud verso Yokote e Yuzawa, a nord verso Akita, a est verso Kakunodate, Tazawako, Morioka e lo Tohoku Shinkansen, e proseguono fino a Tokyo via Akita Shinkansen. Prenota online i treni da e per Daisen su Rail Monsters.