Ninohe è un punto di accesso ferroviario nella parte settentrionale della Prefettura di Iwate, situato sulla Tohoku Shinkansen tra Morioka e Hachinohe. La città ha una sola principale stazione passeggeri, Ninohe Station, dove i servizi ad alta velocità JR East si collegano con la linea regionale IGR Iwate Galaxy Railway. Questa posizione rende Ninohe utile per viaggiare tra la regione settentrionale del Tohoku e il corridoio di Tokyo.
I biglietti del treno per Ninohe coprono due diversi ruoli ferroviari nella stessa stazione. JR East gestisce i servizi Tohoku Shinkansen per i viaggi a lunga percorrenza nell'est del Giappone, mentre IGR Iwate Galaxy Railway opera treni regionali sulla linea convenzionale attraverso Iwate e verso il confine con Aomori. Ninohe Station è la principale stazione ferroviaria per entrambi i tipi di servizio, quindi i trasferimenti tra treni ad alta velocità e regionali avvengono nello stesso complesso ferroviario.
Le linee ferroviarie da Ninohe vanno verso sud in direzione di Morioka, Sendai, Omiya, Ueno e Tokyo, e verso nord in direzione di Hachinohe e Shin-Aomori. I treni regionali collegano Ninohe con fermate minori lungo il corridoio della Iwate Galaxy Railway, inclusi Metoki e Iwate-Numakunai. Prenota online i treni da e per Ninohe su Rail Monsters.