Shirakawa, nota per la sua importanza storica e bellezza scenica, ha diversi collegamenti ferroviari. Il percorso da Shirakawa a Takayama copre circa 79 chilometri e impiega circa 2 ore con i servizi espresso limitato. Un altro collegamento notevole è quello da Shirakawa a Nagoya, che copre circa 180 chilometri, il quale solitamente richiede un cambiamento alla stazione di Gifu e impiega circa 3-4 ore di tempo di viaggio totale. Inoltre, ci sono treni che collegano Shirakawa a Kyoto, che si trova a circa 220 chilometri di distanza, comportando trasferimenti e impiegando circa 4 ore. I servizi locali collegano anche Shirakawa alla città vicina di Gifu, migliorando l'accessibilità regionale.