Viaggiare tra Trofa e Nine in Portogallo comporta principalmente il servizio dei treni regionali Comboios de Portugal (CP). Su questa tratta, i treni Alfa Pendular non sono disponibili, poiché il viaggio è coperto dai treni Intercidades e Regionali, che operano a velocità comprese tra 80 km/h e 120 km/h (50 mph e 75 mph). I treni Intercidades servono i principali nodi, offrendo un'alternativa più veloce ai servizi Regionali più frequenti, che si fermano in stazioni più piccole lungo il percorso.
La durata del viaggio varia; l'Intercidades impiega circa 45 minuti, mentre i treni Regionali possono richiedere fino a 1 ora e 15 minuti, a seconda del numero di fermate. Entrambi i servizi sono progettati con comodi posti a sedere e servizi di base, rendendoli adatti ai passeggeri che viaggiano per affari o per svago. I treni Intercidades sono consigliati per coloro che danno priorità al tempo di viaggio, mentre i treni Regionali possono servire chi ha un itinerario più rilassato, consentendo di ammirare i panorami della campagna portoghese.