アヌシーはオート・サヴォワにある主要な鉄道拠点で、フランス・アルプス、ローヌ渓谷、そしてジュネーブ地域の間に位置しています。市内には主要な旅客駅であるアヌシー駅が1つあり、広い市街地には追加のローカル停車駅があります。SNCF Voyageurs がフランス国内の主要鉄道サービスを提供し、Leman Express がアヌシーをジュネーブ周辺の国境を越える鉄道網へ結んでいます。
アヌシー発の列車には、パリ方面の TGV INOUI、フランス東部を走る TER Auvergne-Rhone-Alpes の地域列車、そしてスイス国境方面へ向かう Leman Express があります。アヌシー駅は長距離、地域、国境を越える出発の主要駅であるため、市内の多くの列車チケットはこの駅を出発地または目的地として利用します。
アヌシー発の鉄道路線は、北西へパリと全国高速鉄道網、南西へリヨンとローヌ渓谷、南へシャンベリとグルノーブル、北東へジュネーブ、アヌマス、Leman Express 網へと伸びています。アヌシー発着の列車は Rail Monsters でオンライン予約できます。