Atami to kluczowy węzeł kolejowy na japońskim korytarzu Tōkaidō, położony między rejonem Tokio a środkową Japonią. Miasto ma jeden główny dworzec dalekobieżny, Atami Station, oraz lokalne przystanki kolejowe, takie jak Kinomiya. JR Central obsługuje Atami na linii Tokaido Shinkansen, a JR East prowadzi linie konwencjonalne łączące miasto z Kanagawą, Shizuoką i Półwyspem Izu.
Pociągi z Atami obejmują szybkie połączenia Tokaido Shinkansen, ekspresy ograniczone JR East, takie jak Odoriko i Saphir Odoriko, oraz regularne pociągi lokalne na linii Tokaido i linii Ito. Atami Station jest głównym dworcem dla biletów kolejowych obejmujących Tokio, Jokohamę, Mishimę, Nagoję, Ito i Izukyu-Shimodę, a przesiadki między usługami Shinkansen i pociągami konwencjonalnymi odbywają się w tym samym kompleksie stacyjnym.
Trasy kolejowe z Atami biegną na wschód w kierunku Tokio, Shinagawy i Jokohamy, na zachód w kierunku Mishimy, Shizuoki, Nagoi i Kioto oraz na południe w kierunku Ito i Półwyspu Izu. Pociągi do Atami sprawiają też, że miasto jest punktem przesiadkowym dla podróżnych przemieszczających się między Tokaido Shinkansen a regionalnymi połączeniami Izu. Zarezerwuj online pociągi z i do Atami w Rail Monsters.