El Aioun serve como um centro regional na rede ferroviária de Marrocos, ligando várias cidades em todo o país. A principal estação de trem em El Aioun oferece conexões para as principais cidades, incluindo Marrakech e Casablanca, entre outras. A estação faz parte da rede da ONCF (Office National des Chemins de Fer), que oferece serviços tanto para o transporte de passageiros quanto de carga. Embora não seja tão grande quanto outras estações marroquinas, El Aioun desempenha um papel vital na facilitação de viagens dentro da região. Serviços de trem frequentes atendem às necessidades de trabalhadores e viajantes, garantindo acesso às principais destinos.