Байонна — важный железнодорожный узел на юго-западе Франции, расположенный на атлантическом коридоре между Бордо, Баскским побережьем и испанской границей. В городе есть одна основная пассажирская железнодорожная станция, Gare de Bayonne, и его обслуживает SNCF Voyageurs по линиям TGV INOUI, TER Nouvelle-Aquitaine и Intercites de nuit.
Поезда из Байонны включают высокоскоростные рейсы TGV INOUI в направлении Парижа, региональные рейсы TER вдоль линий Адур и Баскского побережья, а также ночные поезда на отдельных дальних маршрутах. Gare de Bayonne — главная железнодорожная станция как для дальних, так и для региональных перевозок, с сообщением в сторону прибрежных городов, внутренних маршрутов Пиренеев и основной линии Бордо.
Железнодорожные маршруты из Байонны идут на север в сторону Дакса, Бордо и Парижа, на юг — в сторону Биаррица, Сен-Жан-де-Люза и Андая, а на восток — в сторону По, Лурда и Тулузы. Для пересечения границы с Испанией обычно используется Андай как пункт пересадки. Бронируйте поезда из Байонны и в Байонну онлайн на Rail Monsters.