Фудзи — это региональный железнодорожный узел в восточной части префектуры Сидзуока, расположенный на коридоре Токайдо между Токио, Сидзуокой, Нагоей и Осакой. В городе есть две основные пассажирские станции для междугородних поездок: станция Син-Фудзи на линии Токайдо-синкансэн и станция Фудзи на обычных линиях JR Central. Син-Фудзи — одна из немногих станций синкансэна в Японии, которая не соединена напрямую с обычной станцией JR железной дорогой, поэтому путешественникам следует проверить, какая станция Фудзи указана в их билете.
JR Central обслуживает основные поезда из Фудзи. Поезда Kodama Shinkansen останавливаются на Син-Фудзи для высокоскоростных поездок по Токайдо-синкансэн, тогда как станция Фудзи обслуживает региональные поезда линии Токайдо хонсэн и линию Минобу на север через внутренние районы префектур Сидзуока и Яманаси. Пересадка между Син-Фудзи и станцией Фудзи осуществляется на местном автобусе, такси или автомобиле, а не по прямой железнодорожной линии.
Железнодорожные маршруты из Фудзи идут на восток в сторону Мисимы, Атами, Иокогамы и Токио, на запад в сторону Сидзуоки, Хамамацу, Нагои и Осаки, а на север в сторону Фудзиномии, Минобу и Кофу по линии Минобу. Забронировать поезда из Фудзи и в Фудзи онлайн можно на Rail Monsters.