Наґано має суттєві залізничні послуги, які з'єднують його з різними регіонами. Головна станція, станція Наґано, є важливою зупинкою на лінії Хокуріку Сінкансен, забезпечуючи швидкий доступ до Токіо, Каназава і Тоями. Крім того, місцеві лінії, такі як Наґано електрична залізниця, з'єднують з найблищими напрямками, такими як Юданака і Сібу на лінії Наґаден. Станція також обслуговує маршрути до навколишніх гірських районів, які приваблюють туристів, особливо взимку для катання на лижах. Загалом, залізничні з'єднання забезпечують зручні варіанти подорожей до і з Наґано.