Noboribetsu liegt an der JR Hokkaido Muroran-Hauptlinie im südlichen Hokkaido zwischen Tomakomai und Higashi-Muroran. Die Stadt hat einen wichtigen Fernbahnhof, den Bahnhof Noboribetsu, der als Halt für Limited-Express- und Regionalzüge dient und nicht als Endbahnhof. Seine Rolle im Bahnnetz ist mit dem Korridor Sapporo - Hakodate verbunden, einer der wichtigsten konventionellen Bahnstrecken Hokkaidos.
Zu den Zügen ab Noboribetsu gehören JR-Hokkaido-Limited-Express-Verbindungen wie Hokuto auf der Achse Sapporo - Hakodate, Suzuran-Verbindungen in Richtung Sapporo und Muroran sowie Regionalzüge entlang der Muroran-Hauptlinie. Das Shinkansen-Netz Japans erreicht Noboribetsu nicht; der Zugang per Hochgeschwindigkeitszug erfordert die Reise über Shin-Hakodate-Hokuto im südlichen Hokkaido.
Die Bahnstrecken ab Noboribetsu verlaufen nordöstlich in Richtung Tomakomai, Minami-Chitose, Verbindungen zum New Chitose Airport und Sapporo sowie südwestlich in Richtung Higashi-Muroran, Toya, Oshamambe, Shin-Hakodate-Hokuto und Hakodate. Für regionale Reisen verbinden JR-Hokkaido-Regionalzüge Noboribetsu mit nahe gelegenen Bahnhöfen im Muroran-Gebiet. Buchen Sie Züge von und nach Noboribetsu online bei Rail Monsters.