Joetsu est une gare de correspondance ferroviaire dans le sud-ouest de la préfecture de Niigata, située entre le corridor du Hokuriku Shinkansen et les lignes conventionnelles le long de la côte de la mer du Japon. La ville compte deux principales gares voyageurs pour les trajets interurbains : la gare de Joetsumyoko pour les services de trains à grande vitesse et la gare de Naoetsu pour les trains régionaux et express limités. JR East, JR West, Echigo Tokimeki Railway et Hokuetsu Express desservent tous la région de Joetsu.
La gare de Joetsumyoko est l’arrêt TGV de la ville, desservi par les services Hokuriku Shinkansen circulant vers l’est en direction de Nagano et Tokyo, et vers l’ouest en direction de Toyama, Kanazawa et Tsuruga. La gare de Naoetsu gère les itinéraires régionaux sur le réseau d’Echigo Tokimeki Railway, les services express limités de JR East vers Niigata, ainsi que les trains Hokuetsu Express à travers l’intérieur de Niigata.
Les lignes ferroviaires au départ de Joetsu partent vers le sud et l’est en direction de Nagano, Takasaki, Omiya et Tokyo, vers l’ouest le long du corridor du Hokuriku vers Toyama et Kanazawa, vers le nord en direction de Kashiwazaki et Niigata, et le long de la ligne côtière vers Itoigawa. Réservez en ligne des trains au départ et à destination de Joetsu sur Rail Monsters.